1956年

朱裕璧、董道蕴等医学先贤筚路蓝缕，在东湖之滨播下医学火种，“湖北医学院附属第二医院”由此扎根生长。8月，医院门诊正式开诊。

1963年

中国首批援非医疗队24名队员出征，骨科黄克俊教授随队远赴阿尔及利亚。

医院获批成立全省首个肿瘤科。

1976年

我国著名传染病学专家桂希恩教授自青海归来，此后半个世纪扎根传染病学，舍身忘己带领无数患者走向阳光，2004年被评为“感动中国”年度人物，2010年被省政府授予“人民医学家”荣誉称号。

1986年

外科创始人史海安教授完成国内首例、世界医学史上年龄最小的共肝连体婴儿分离手术。

1993年

医院更名为“湖北医科大学附属第二医院”。

1994年

医院获批成为全国首批三级甲等医院。

1996年

泌尿外科胡礼泉教授主编的《临床男科学》出版，这是我国第一部反映当代临床男科学水平的专著。

1997年

我国显微外科创始人之一陈振光团队完成《带血管蒂股骨大转子骨瓣移位术的基础及临床研究》，获国家科技进步三等奖，填补了湖北省该领域长达12年的空白。

2000年

原武汉大学、原武汉水利电力大学、原武汉测绘科技大学、原湖北医科大学合并组建新武汉大学，医院正式更名为武汉大学中南医院/第二临床学院。

2001年

中国首张具有18位点的基因型身份证明在中南医院基因诊断中心诞生。同年10月，医院成立宁养院，成为省内唯一免费上门为经济困难的晚期癌症患者提供安宁服务机构。

2006年

法国时任总统希拉克到访，出席中法合作急救中心竣工仪式，并为中法肝胆疾病研究院奠基。他题词“法中两国共同携手，战胜疾病，重现希望”，盛赞医院为中法医学合作典范。

2012年

医院获全国首家心脏死亡捐献（DCD）器官移植资质。

2021年

国家人体捐献器官获取质量控制中心成立并落户武汉大学中南医院，是我国中部地区首个国家级医疗质控中心。

2022年

医院获批国家紧急医学救援基地（湖北），并成立医学研究院、药学研究院、交叉研究院。

2023年

叶旭军、宋威团队围绕“肿瘤—器官互作”在《自然》（Nature）发表研究成果，这是全省医疗机构首篇拥有完全自主知识产权的Nature正刊论文。

2024年

医院获批国家（湖北）紧急医学救援队，成为湖北省在该领域获批的首支“国家队”。

2025年

医院成立医学人工智能研究院。冯玲获第50届南丁格尔奖章，成为湖北省首位获此奖章者。

2026年

武汉大学中南医院光谷院区（光谷人民医院）启用。