湖北日报讯 (记者汪彤、通讯员杨文、龚丝雨)一群活蹦乱跳的蛋鸭在育种家眼前,哪些产蛋能力更强、对环境适应性更好?一张芯片揭晓答案。10月25日从省农科院获悉,该院畜牧兽医研究所与北京康普森农业科技有限公司共同开发出全国首款蛋鸭育种芯片——“楚鸭1号”。该产品填补了国内空白,具有完全自主知识产权,检测准确率超98%,可将高产蛋鸭的育种效率提高一倍。
我国蛋鸭饲养量、消费量约占全球80%,种源自给率100%。然而,传统畜禽育种方式周期长、效率低。据悉,选育一个蛋鸭新品种至少要经过6个世代,每世代至少需72周才能完成。如全国首个适合笼养的蛋鸭新品种“农湖2号”,2021年通过审定,由湖北省农科院联合多家单位历经16年育成。
育种芯片是对生物个体基因组变异进行检测和开展遗传评估的重要工具之一,可精确检测生物个体的基因型,提高遗传评估准确性,提前淘汰达不到育种目标的个体或组合,从而减少工作量和成本投入。
如何创制育种芯片?搜集、获取丰富的基因信息是关键。
“‘农湖2号’相当于一个现成的高产蛋鸭‘基因库’。”省农科院畜牧兽医研究所吴艳博士介绍,该品种以湖北地方鸭品种资源——荆江鸭为育种基础,引入绍兴鸭、山麻鸭、攸县麻鸭、金定鸭为育种素材,其亲本血缘覆盖国内主要高产地方鸭品种。通过农湖2号蛋鸭核心种群个体进行深度重测序,用全基因组关联分析、候选基因分析等方法,科研人员筛选获得与蛋鸭产蛋性状、生长性状与抗逆性状等相关的2万个功能基因位点,最终开发出“楚鸭1号”蛋鸭育种液相芯片。
试验验证表明,该产品基因组覆盖全面,且涵盖了蛋鸭主要经济性状的功能位点,检测一个样本仅需40元左右,准确率高达98%以上。同时,芯片密度可灵活调整,随时补充功能位点,在蛋鸭基因组选择育种、重要经济性状定位与鉴定、家系构建、群体遗传学研究等方面应用前景广阔。
吴艳期待地说,有了“楚鸭1号”芯片助力,未来,他们将综合运用基因组芯片育种等新技术,对“农湖2号”蛋鸭的生产性能进行持续提升,进一步提高品种市场竞争力。